本公開公開了一種綜合能源系統(tǒng)多目標(biāo)集成設(shè)計(jì)與優(yōu)化控制方法及系統(tǒng)，包括：確定系統(tǒng)參數(shù)設(shè)計(jì)、容量配置和優(yōu)化控制的優(yōu)化目標(biāo)、優(yōu)化變量和約束條件；根據(jù)確定的優(yōu)化目標(biāo)、優(yōu)化變量和約束條件，采用多目標(biāo)遺傳算法求得優(yōu)化變量Pareto最優(yōu)解集，通過模糊決策方法得到最優(yōu)解；判斷是否達(dá)到最優(yōu)解集的最大代數(shù)：如果否，則進(jìn)行重新優(yōu)化；如果是，則最優(yōu)解作為最終控制方案；本公開通過考慮綜合能源系統(tǒng)的整體效率或者參數(shù)設(shè)計(jì)、容量配置和優(yōu)化控制三者的遞進(jìn)關(guān)系，實(shí)現(xiàn)能量效率、運(yùn)行經(jīng)濟(jì)性和新能源消納水平等的協(xié)同優(yōu)化設(shè)計(jì)與運(yùn)行控制。