本發(fā)明提供一種燃料電池系統(tǒng)的熱待機(jī)運(yùn)行控制方法、燃料電池系統(tǒng)、存儲(chǔ)介質(zhì)以及電子裝置。本發(fā)明方法，包括：計(jì)算燃料電池系統(tǒng)中電堆的輸出電流值，降低所述燃料電池系統(tǒng)中電堆的輸出電流值，切斷電堆及系統(tǒng)內(nèi)置鋰電池并聯(lián)后系統(tǒng)對(duì)外輸出的途徑，得到所述燃料電池系統(tǒng)的初始運(yùn)行策略；基于所述燃料電池系統(tǒng)的初始運(yùn)行策略，進(jìn)入熱待機(jī)第一階段，聯(lián)通電堆與燃料電池系統(tǒng)內(nèi)置鋰電池，使電堆以小電流對(duì)鋰電池充電；當(dāng)燃料電池系統(tǒng)內(nèi)置鋰電池達(dá)到電量充滿(mǎn)的狀態(tài)，停止執(zhí)行熱待機(jī)第一階段，進(jìn)入熱待機(jī)第二階段，得到所述燃料電池系統(tǒng)的最終運(yùn)行策略。本發(fā)明的技術(shù)方案解決了現(xiàn)有技術(shù)中的系統(tǒng)二次啟動(dòng)時(shí)間長(zhǎng)、系統(tǒng)頻繁啟停壽命降低的問(wèn)題。